More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1787 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 91 aa  184  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  76.92 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  67.03 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  64.84 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  63.33 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  62.07 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  53.85 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.19 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 88 aa  97.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  60.87 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  63.77 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  51.06 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  49.45 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  50.55 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  46.15 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  51.76 
 
 		 88 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  54.76 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  51.11 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  47.25 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  56.16 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  60.29 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  56.34 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>