More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0012 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 
91 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 
89 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  52.75 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  53.85 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  52.75 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 
89 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  53.85 
 
 
89 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.75 
 
 
89 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  51.06 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  54.76 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  62.32 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  62.32 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  55.29 
 
 
88 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  47.25 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 
89 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  50.56 
 
 
88 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  50.55 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  48.35 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  48.35 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  59.42 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
88 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  53.85 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  42.86 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  42.86 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  48.35 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  47.25 
 
 
89 aa  84.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  46.15 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  46.15 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  46.15 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  58.57 
 
 
87 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  55.71 
 
 
95 aa  84  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  48.35 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  53.33 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  57.97 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  49.45 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  48.35 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  51.11 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  43.96 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0231  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0167652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  47.78 
 
 
90 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  42.86 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  45.05 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  53.62 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>