More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1985 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  76.92 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  72.53 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  65.93 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  63.33 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  60.47 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  65.22 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  53.85 
 
 		 89 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  50.55 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 87 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  56.47 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  56.47 
 
 		 87 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  56.04 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  91.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  57.33 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  47.78 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  46.15 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>