More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1592 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  93.18 
 
 
88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  90.91 
 
 
88 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  87.5 
 
 
88 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  87.5 
 
 
88 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  80.68 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  78.41 
 
 
88 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  72.73 
 
 
88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  72.73 
 
 
89 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  72.73 
 
 
88 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  72.41 
 
 
88 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 
89 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  72.73 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  72.94 
 
 
89 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  68.18 
 
 
88 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.67 
 
 
87 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  68.97 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
89 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 
89 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  65.52 
 
 
89 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  71.95 
 
 
87 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 
89 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
89 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
89 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  65.52 
 
 
89 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 
87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 
87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  66.67 
 
 
89 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  65.52 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  70.73 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  65.52 
 
 
89 aa  117  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
89 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 
89 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 
89 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  65 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  62.5 
 
 
88 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  63.22 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  114  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  67.07 
 
 
89 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  65.88 
 
 
91 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 
90 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 
90 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
89 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 
89 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 
86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  63.53 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  65.85 
 
 
100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  59.77 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.017638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>