More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3584 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 100 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  75.82 
 
 		 91 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  137  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  75.28 
 
 		 89 aa  136  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  72.73 
 
 		 90 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0783  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  72.29 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  85.39 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  70.37 
 
 		 88 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3955  ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2131  SSU ribosomal protein S15P  79.78 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1509  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.696387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>