More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  73.03 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  74.71 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  129  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  70.59 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  63.86 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  65.88 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  64.71 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  67.9 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  62.03 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0783  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2131  SSU ribosomal protein S15P  76.4 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  62.03 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  56.96 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  64.2 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>