More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0791 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  64.29 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  56.67 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>