More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0614 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  66.67 
 
 
88 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  64.77 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  67.44 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  65.12 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  66.28 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  67.9 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  65.06 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  60.47 
 
 
89 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  63.1 
 
 
91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  63.95 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  60.47 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  64.2 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  55.81 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 
87 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  58.14 
 
 
100 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  64.2 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  62.96 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  59.3 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
126 aa  105  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  62.96 
 
 
89 aa  105  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  55.17 
 
 
88 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  58.02 
 
 
89 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
89 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  59.3 
 
 
90 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
88 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
89 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  55.81 
 
 
89 aa  103  7e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  61.63 
 
 
89 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
88 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
89 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  60.49 
 
 
89 aa  102  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
88 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
89 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  56.98 
 
 
89 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  54.88 
 
 
89 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
95 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  53.49 
 
 
89 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  100  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
89 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  56.98 
 
 
89 aa  100  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  55.42 
 
 
89 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  51.16 
 
 
89 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
89 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
89 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  52.33 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>