More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1951 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  73.56 
 
 		 88 aa  133  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  73.56 
 
 		 88 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  120  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 87 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 87 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 87 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  119  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  116  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 90 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  61.63 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>