More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2220 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  176  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  140  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  133  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2082  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2099  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2145  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0715558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  70.59 
 
 
91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  69.32 
 
 
90 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12798  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 
89 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2163  ribosomal protein S15  82.02 
 
 
89 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 
89 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2349  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 
89 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.111159  hitchhiker  0.00348577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4024  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 
89 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 
89 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  65.17 
 
 
100 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1734  ribosomal protein S15  82.02 
 
 
89 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.439379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  120  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  120  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  63.95 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  63.53 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 
89 aa  116  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14680  SSU ribosomal protein S15P  78.65 
 
 
89 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
126 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  61.63 
 
 
88 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
90 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  110  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
95 aa  107  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
87 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>