More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1363 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  77.78 
 
 
90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  75.56 
 
 
90 aa  137  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  74.44 
 
 
90 aa  135  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 
91 aa  130  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  70 
 
 
90 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  70 
 
 
90 aa  128  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  70 
 
 
90 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  70 
 
 
90 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  65.56 
 
 
90 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  61.36 
 
 
89 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  61.63 
 
 
88 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  54.02 
 
 
90 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.76 
 
 
88 aa  104  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  103  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
100 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 
89 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 
89 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 
87 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  58.54 
 
 
87 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  54.44 
 
 
91 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
126 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  60.98 
 
 
88 aa  99  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  52.87 
 
 
90 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 
89 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.7  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  54.55 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>