More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3809 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  70.79 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3261  30S ribosomal protein S15  71.95 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1419  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22503  normal  0.956384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  70.89 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>