More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7877 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  74.42 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  71.91 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  68.18 
 
 		 90 aa  123  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2131  SSU ribosomal protein S15P  75.28 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 88 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  62.65 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>