More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0726 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
90 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 
90 aa  133  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 
90 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  74.16 
 
 
90 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 
90 aa  124  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  64.37 
 
 
90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  108  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.79 
 
 
88 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  61.36 
 
 
87 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  57.95 
 
 
89 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 
89 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 
88 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  50.55 
 
 
95 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 
88 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
100 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  49.45 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
87 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
87 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  51.65 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.35 
 
 
95 aa  97.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
95 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>