More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3587 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  93.26 
 
 		 89 aa  169  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  67.44 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  63.95 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  64.29 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  62.35 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  61.36 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  57.83 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>