More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0789 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  65.93 
 
 		 95 aa  130  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  67.03 
 
 		 95 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  62.64 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  60.24 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  62.96 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  55.68 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  54.44 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  57.95 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 95 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  54.55 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  57.32 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>