More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1458 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  55.95 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  57.83 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  57.83 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>