More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4508 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  98.88 
 
 		 89 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  98.88 
 
 		 89 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  89.89 
 
 		 89 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  88.76 
 
 		 89 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  74.16 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  133  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  62.92 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>