More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2817 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2817  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  185  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  97.8 
 
 
91 aa  180  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  63.64 
 
 
89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 
89 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  60.23 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  105  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  60.23 
 
 
89 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 
89 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  54.44 
 
 
92 aa  104  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>