More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0964 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  180  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  87.64 
 
 		 89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  157  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  87.64 
 
 		 89 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  85.39 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  69.66 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0628  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1099  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0916  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.275461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  59.34 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>