More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1006 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  70.79 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0163  30S ribosomal protein S15  68.35 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0073  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  67.09 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  67.09 
 
 		 86 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0079  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2686  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>