More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2437 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  87.64 
 
 		 89 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  156  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 88 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 88 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 86 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 88 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  63.95 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  64.71 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  60.67 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>