More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2509 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  87.64 
 
 		 89 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 		 89 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  70.24 
 
 		 88 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  71.08 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 86 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  64.71 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  69.62 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0816  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 90 aa  110  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>