More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1307 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  88.64 
 
 		 88 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  87.5 
 
 		 88 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  84.09 
 
 		 88 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  80.68 
 
 		 88 aa  146  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  80.68 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  72.73 
 
 		 88 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  71.59 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  71.59 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  74.71 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  74.71 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  74.71 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  72.41 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  67.05 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  69.41 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  64.37 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  120  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  68.18 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  63.22 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  64.71 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  60.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  59.09 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  60.92 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  59.52 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>