More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3848 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  64.63 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  57.3 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  63.75 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  63.41 
 
 		 87 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  56.98 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  63.75 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>