More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3193 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  91.01 
 
 		 89 aa  167  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  83.15 
 
 		 89 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  80.9 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  146  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  79.78 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  143  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  143  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  76.4 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0027  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  68.54 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 		 89 aa  121  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  62.5 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  62.5 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1398  SSU ribosomal protein S15P  60.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>