More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0402 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  82.02 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  147  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  49.44 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  48.31 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  44.94 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>