More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1313 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  176  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  63.53 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  67.07 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  60.23 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  60.92 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  62.2 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  58.14 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  59.76 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  57.14 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  60.98 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  56.32 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_7893  predicted protein  61.18 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.853568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  55.81 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  57.47 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  56.1 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  53.66 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>