More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5113 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  80.9 
 
 
89 aa  144  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  74.16 
 
 
89 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  75.28 
 
 
89 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  70.79 
 
 
100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  74.16 
 
 
89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  75 
 
 
90 aa  133  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  76.4 
 
 
89 aa  133  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  133  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  70.79 
 
 
91 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  65.17 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
126 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  67.47 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
88 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  65.12 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1067  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.325142  normal  0.0149181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  61.8 
 
 
89 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3325  ribosomal protein S15  79.78 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1380  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1338  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00957832  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
95 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 
90 aa  107  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2131  SSU ribosomal protein S15P  77.53 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  105  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1517  ribosomal protein S15  74.16 
 
 
89 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>