More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12283 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 88 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  96.7  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  93.2  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  93.2  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  47.19 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  56.47 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  52.38 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  90.5  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  45.98 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  47.56 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  48.78 
 
 		 87 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  44.83 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1168  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  43.82 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  44.83 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>