More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0208 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  97.75 
 
 
89 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  88.76 
 
 
89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 
89 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  69.66 
 
 
89 aa  126  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.79 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  60 
 
 
87 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 
87 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 
87 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  104  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 
89 aa  103  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 
89 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
88 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
90 aa  102  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
90 aa  102  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
88 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  59.52 
 
 
88 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 
88 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  100  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  55.06 
 
 
89 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>