More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1582 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1283  SSU ribosomal protein S15P  78.65 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  140  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  59.3 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  58.33 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  58.54 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  55.06 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  51.69 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  60.47 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  57.14 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>