More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl284 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  79.55 
 
 
88 aa  146  8e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
89 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
88 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  56.63 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  55.17 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
88 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
88 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
88 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  56.1 
 
 
88 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  57.32 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  57.32 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  52.87 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  56.1 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
88 aa  91.3  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  48.84 
 
 
95 aa  90.5  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  48.84 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  49.43 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  53.66 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  52.44 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  51.22 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  50.57 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  50 
 
 
95 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  48.84 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0834  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  57.32 
 
 
84 aa  87.8  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  54.88 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  50.57 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>