More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1445 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  65.93 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  65.91 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  60.44 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  55.43 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  51.19 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  53.49 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  48.31 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  52.44 
 
 		 100 aa  85.9  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  53.33 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0330  30S ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0710239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  47.25 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl284  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  47.13 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  48.89 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  48.89 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  47.19 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  43.82 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  43.82 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  41.57 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  44.32 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  49.43 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  42.7 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  48.78 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  47.19 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>