More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0142 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
91 aa  184  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
89 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  59.04 
 
 
88 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  61.45 
 
 
88 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  57.95 
 
 
89 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  59.3 
 
 
88 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  60.71 
 
 
87 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0379  ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000512971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.98 
 
 
88 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  58.33 
 
 
88 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2416  ribosomal protein S15  58.02 
 
 
88 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.04 
 
 
88 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  54.55 
 
 
89 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  53.49 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  55.42 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  55.42 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  55.42 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  52.22 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  50 
 
 
95 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  51.14 
 
 
89 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  53.57 
 
 
87 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  53.57 
 
 
87 aa  93.6  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>