More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0379 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0379  ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  177  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000512971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0034  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  56.18 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0483  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397496  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0604  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1695  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000686217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0142  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000446428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0228  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00134414  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0437  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>