More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1775 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  141  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  137  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 
89 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  54.65 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
88 aa  94  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  48.28 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  46.59 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  48.31 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  48.86 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  90.5  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  48.31 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  88.6  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  43.18 
 
 
95 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  48.81 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  44.94 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2220  ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000029648  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  43.82 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0379  ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  87  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000512971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  45.98 
 
 
88 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  51.16 
 
 
88 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  43.18 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  44.32 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  48.28 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  49.43 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  44.94 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  49.44 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>