More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0406 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  55.17 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  50 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0533  ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  45.45 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  54.76 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  46.07 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  47.19 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  47.19 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>