More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0304 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0304  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  180  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519834  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 		 89 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0402  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0216687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1775  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  141  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.380216  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1458  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000852851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0371  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0406  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0340335  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  103  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  56.18 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0789  ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000101038  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  54.02 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  95.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  56.63 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.88 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  51.69 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  52.81 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0195  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.10156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  93.2  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  48.31 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07610  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.923789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1040  30S ribosomal protein S15  44.94 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000106655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  48.31 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0824  ribosomal protein S15  46.07 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>