More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2018 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  114  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
90 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3602  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3471  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3639  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3540  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3577  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3471  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3606  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3461  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.22404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  59.55 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3343  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.644233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4485  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3462  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3414  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.350426  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3236  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3277  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0588  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258599  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1131  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00579414  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3727  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0997242  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3593  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.113046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3996  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.842941  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0492  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.156818  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0811  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1010  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.876313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 
88 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0993  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.163035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3386  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2824  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.103503  hitchhiker  0.00366524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3558  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  55.06 
 
 
89 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3057  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  52.38 
 
 
91 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  100  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  57.47 
 
 
88 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  50.56 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1207  30S ribosomal protein S15  52.81 
 
 
89 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  56.1 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  53.93 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0373  30S ribosomal protein S15  50.56 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  50.56 
 
 
100 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  56.32 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  51.69 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>