More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1128 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  100 
 
 		 88 aa  179  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  71.59 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  69.32 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002612  SSU ribosomal protein S15p (S13e)  72.41 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0601  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.831516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  72.41 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01764  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00913478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  67.82 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  67.82 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1698  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2994  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0744  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2760  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1488  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  69.51 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  61.18 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  60.92 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  60.98 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  57.47 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1464  ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  64.63 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0964  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0254424  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  64.77 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000371083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3515  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2831  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926546  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  59.77 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1258  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1029  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.553716  hitchhiker  0.000000919084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1094  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1033  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236683  hitchhiker  0.0000205834 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>