More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2299 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  178  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  124  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09151  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10261  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  114  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.176964  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09171  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.265741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  65.91 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0267  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.600979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15851  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0856  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.120677  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09361  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00615512  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  55.81 
 
 
88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1299  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1160  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.908133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  57.95 
 
 
89 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  56.82 
 
 
89 aa  104  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07011  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.258215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  55.68 
 
 
89 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  54.65 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  47.73 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  51.72 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  50.62 
 
 
87 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0231  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0167652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  54.55 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  50 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  53.09 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  47.67 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  47.73 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  46.51 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3881  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
90 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 
95 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  93.6  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  93.6  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  50 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2168  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716102  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  52.27 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  51.85 
 
 
87 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2080  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0185155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  52.44 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  53.41 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  53.09 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 
89 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0726  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
91 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000147654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6518  ribosomal protein S15  46.51 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.62719  normal  0.131732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>