More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1160 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1160  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.908133 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1299  30S ribosomal protein S15  94.38 
 
 		 89 aa  171  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15851  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 		 89 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07011  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.258215 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0856  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.120677  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0267  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.600979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09361  30S ribosomal protein S15  76.4 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00615512  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09151  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09171  30S ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.265741  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10261  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.176964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  51.72 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  52.27 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  46.59 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  48.15 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0937  ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  50.62 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  46.91 
 
 		 88 aa  87.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  47.67 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2033  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1555  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.268483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  51.85 
 
 		 87 aa  86.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  87  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  49.38 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0568  ribosomal protein S15  45.98 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  43.18 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2018  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00137559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  50.57 
 
 		 88 aa  84.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>