More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0267 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0267  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.600979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09361  30S ribosomal protein S15  98.88 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  hitchhiker  0.00615512  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07011  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.258215 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1299  30S ribosomal protein S15  78.65 
 
 		 89 aa  142  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1160  30S ribosomal protein S15  77.53 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.908133 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09151  30S ribosomal protein S15  74.16 
 
 		 89 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09171  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.265741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0856  30S ribosomal protein S15  71.91 
 
 		 89 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.120677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10261  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.176964  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15851  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2299  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2335  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2284  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4651  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0169  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.44341  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  54.55 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  52.33 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1823  30S ribosomal protein S15  53.41 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000243315  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  52.87 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  94  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 90 aa  94  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1097  30S ribosomal protein S15  52.27 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.069874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  48.86 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0791  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000412622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  53.41 
 
 		 89 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  51.14 
 
 		 89 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0269  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  51.16 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0061  ribosomal protein S15  48.15 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000587421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  87.4  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4030  30S ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.27506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3193  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00194624  normal  0.0112652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 88 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  48.84 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  47.73 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  51.14 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1363  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000765113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  49.41 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  46.51 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  48.86 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1718  ribosomal protein S15  46.91 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000241512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  46.59 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0614  ribosomal protein S15  48.28 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.318285  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  50 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  45.45 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  47.73 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1006  ribosomal protein S15  44.32 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.148359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>