More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0045 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0045  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
719 aa  1463    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  47.76 
 
 
759 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
655 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  28.25 
 
 
749 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  43.2 
 
 
655 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  41.42 
 
 
656 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  41.42 
 
 
656 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.99 
 
 
328 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  40.37 
 
 
319 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  33.46 
 
 
709 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
637 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  38.12 
 
 
307 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
315 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  38.36 
 
 
317 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
322 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 
317 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.33 
 
 
298 aa  127  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.25 
 
 
303 aa  127  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.85 
 
 
236 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2444  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.18 
 
 
229 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000188115  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2621  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.14 
 
 
246 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0540  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.42 
 
 
240 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.87 
 
 
303 aa  121  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.73 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2505  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.14 
 
 
232 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.64 
 
 
301 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3418  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.76 
 
 
240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.116104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.26 
 
 
320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.88 
 
 
654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2771  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.76 
 
 
245 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3906  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.55 
 
 
231 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.67 
 
 
431 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.11 
 
 
275 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0582  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02365  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.37 
 
 
232 aa  114  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0131  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0614  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3696  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  114  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 
751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0515  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.36 
 
 
245 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 
618 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.44 
 
 
230 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0218  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.58 
 
 
245 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.51 
 
 
643 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  34.97 
 
 
778 aa  107  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1172  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.69 
 
 
256 aa  107  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.62 
 
 
625 aa  107  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.91 
 
 
640 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  41.67 
 
 
626 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3681  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.32 
 
 
235 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 
640 aa  106  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3492  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3495  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3457  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  39.57 
 
 
691 aa  105  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  34.43 
 
 
778 aa  105  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  41.43 
 
 
706 aa  104  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 
705 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2493  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 
779 aa  104  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1273  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 
643 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  38.73 
 
 
797 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3292  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 
643 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0413  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.79 
 
 
256 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0634  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.86 
 
 
261 aa  104  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  38.73 
 
 
794 aa  104  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1481  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.16 
 
 
238 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317194  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.21 
 
 
291 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2776  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.15 
 
 
234 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.371956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  36.05 
 
 
778 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3053  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.07 
 
 
233 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0934  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.13 
 
 
247 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
1245 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
643 aa  102  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.19 
 
 
687 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
643 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 
824 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.69 
 
 
824 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  37.97 
 
 
799 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  39.46 
 
 
649 aa  102  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0239  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.96 
 
 
247 aa  101  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2854  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.38 
 
 
252 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3309  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.14 
 
 
248 aa  101  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1883  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.76 
 
 
228 aa  101  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2610  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.1 
 
 
234 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  37.34 
 
 
796 aa  101  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3020  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.1 
 
 
234 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360765  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  39.13 
 
 
681 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  39.13 
 
 
777 aa  100  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3374  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.28 
 
 
274 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  39.16 
 
 
804 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
695 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.51 
 
 
776 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.57 
 
 
679 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 
838 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  32.17 
 
 
248 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  35.81 
 
 
721 aa  99.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>