More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4269 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 317 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  71.02 
 
 		 317 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  68.65 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  72.07 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  66.67 
 
 		 328 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  65.8 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  67.56 
 
 		 315 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.14 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.14 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  46.75 
 
 		 656 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  50.55 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  46.1 
 
 		 656 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  48.3 
 
 		 655 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  40.43 
 
 		 850 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  38.59 
 
 		 850 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 		 850 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 850 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 850 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 850 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 850 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 850 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  39.92 
 
 		 850 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  39.92 
 
 		 850 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  38.59 
 
 		 858 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  39.92 
 
 		 850 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  39.92 
 
 		 850 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.11 
 
 		 791 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.74 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  39.5 
 
 		 850 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.56 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 765 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.6 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 637 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 		 752 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 824 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.59 
 
 		 641 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  38.4 
 
 		 851 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.29 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  44.44 
 
 		 761 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  44.38 
 
 		 755 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  38.49 
 
 		 851 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.16 
 
 		 744 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.58 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  42.44 
 
 		 755 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.78 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  39.08 
 
 		 852 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  37 
 
 		 645 aa  143  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.09 
 
 		 760 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  44.02 
 
 		 817 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  38.24 
 
 		 851 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  38.24 
 
 		 851 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  38.24 
 
 		 851 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.22 
 
 		 638 aa  142  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 704 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  36.86 
 
 		 852 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  38.14 
 
 		 851 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  51.97 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  41.36 
 
 		 818 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  43.78 
 
 		 849 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 		 849 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  39.56 
 
 		 762 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  42.53 
 
 		 709 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  41.62 
 
 		 662 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 807 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 		 835 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  37.87 
 
 		 848 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.45 
 
 		 656 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  36.5 
 
 		 589 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.06 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.74 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 		 655 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  40.47 
 
 		 730 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  39.39 
 
 		 759 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  39.2 
 
 		 814 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  39.79 
 
 		 679 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 914 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  42.51 
 
 		 646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  41.18 
 
 		 709 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.71 
 
 		 701 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  37.82 
 
 		 832 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.91 
 
 		 679 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  43.24 
 
 		 849 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 		 750 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  41.85 
 
 		 840 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 		 846 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  39.79 
 
 		 679 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  42.05 
 
 		 818 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  40.85 
 
 		 706 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  36.4 
 
 		 839 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 846 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 834 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 835 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 		 713 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 		 713 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 		 713 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 834 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  36.4 
 
 		 820 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.04 
 
 		 712 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  39.36 
 
 		 713 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  44.07 
 
 		 835 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>