More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0079 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 319 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  91.72 
 
 		 328 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  68.24 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  67.39 
 
 		 317 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  66.88 
 
 		 307 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  72.3 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  66.45 
 
 		 315 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.67 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  51.1 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.65 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  40.29 
 
 		 704 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.66 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 791 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  39.39 
 
 		 850 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  39.39 
 
 		 850 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  39.39 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  39.39 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 850 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  38.03 
 
 		 858 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.57 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  45.4 
 
 		 755 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 		 655 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.12 
 
 		 744 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  38.96 
 
 		 850 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  39.91 
 
 		 850 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.44 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.56 
 
 		 230 aa  146  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 		 655 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0045  glycosyl transferase family 51  40.37 
 
 		 719 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  40.65 
 
 		 851 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  46.62 
 
 		 656 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  46.62 
 
 		 656 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  38.36 
 
 		 851 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.99 
 
 		 679 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.9 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.92 
 
 		 656 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 		 851 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  37.82 
 
 		 824 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 		 851 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  40.09 
 
 		 851 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  38.6 
 
 		 851 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  36.14 
 
 		 868 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  50 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  40.1 
 
 		 662 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  37.22 
 
 		 701 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  36.21 
 
 		 897 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  42.35 
 
 		 817 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  38.43 
 
 		 775 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  42.51 
 
 		 706 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  39.68 
 
 		 749 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  44 
 
 		 762 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.05 
 
 		 230 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  39.63 
 
 		 852 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.6 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  39.13 
 
 		 759 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  33.96 
 
 		 914 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  39.11 
 
 		 814 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  43.75 
 
 		 752 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 641 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  35.55 
 
 		 839 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  39.58 
 
 		 667 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  36.44 
 
 		 705 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  36.91 
 
 		 852 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  42.16 
 
 		 709 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  38.6 
 
 		 912 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.93 
 
 		 821 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 705 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.13 
 
 		 645 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  42.11 
 
 		 791 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  39.64 
 
 		 679 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 637 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  37.1 
 
 		 687 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 765 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  37.29 
 
 		 846 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 839 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 796 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.34 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 		 751 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  34.24 
 
 		 865 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 		 837 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  35.16 
 
 		 844 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  38.3 
 
 		 839 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 790 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 844 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  42.01 
 
 		 679 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 844 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 646 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 824 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  36.19 
 
 		 839 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  40.24 
 
 		 680 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.89 
 
 		 640 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  36.02 
 
 		 705 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>