More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2516 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  57.08 
 
 
431 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  56.09 
 
 
248 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  52.44 
 
 
298 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  54.25 
 
 
303 aa  238  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  49.55 
 
 
303 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  53.3 
 
 
230 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.2 
 
 
275 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  51.44 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.12 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.76 
 
 
320 aa  184  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2444  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.08 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000188115  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3906  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  47.62 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3681  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  56.73 
 
 
235 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2621  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.58 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0540  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.36 
 
 
240 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2505  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.13 
 
 
232 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3418  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.45 
 
 
240 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.116104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  55.63 
 
 
655 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  55.63 
 
 
656 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0131  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.39 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0614  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.39 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  38.16 
 
 
307 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0582  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.13 
 
 
245 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  55.63 
 
 
656 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1481  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.55 
 
 
238 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317194  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.13 
 
 
245 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3696  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.13 
 
 
245 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0515  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.13 
 
 
245 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0201  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.38 
 
 
225 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2771  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40 
 
 
245 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.02 
 
 
291 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.6 
 
 
307 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3202  putative peptidoglycan biosynthesis-related protein  38.37 
 
 
258 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.6 
 
 
307 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  47.24 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  50.7 
 
 
637 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2967  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.63 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  41.35 
 
 
317 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1172  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.86 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3657  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.07 
 
 
240 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.44 
 
 
654 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  40.1 
 
 
749 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0840  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.91 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  44.19 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35 
 
 
618 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1273  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2493  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3982  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.71 
 
 
267 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102904 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0413  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3292  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3374  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.44 
 
 
274 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3492  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3495  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3457  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.61 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
322 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  44.58 
 
 
648 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  41.25 
 
 
655 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0492  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.989398  normal  0.531495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  46.58 
 
 
691 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  36.48 
 
 
795 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 
317 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
315 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.96 
 
 
751 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0027  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  51.85 
 
 
235 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3503  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03073  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0499  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03024  hypothetical protein  38.63 
 
 
242 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3401  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1679  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.09 
 
 
225 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000648781  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3695  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.63 
 
 
242 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2198  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.18 
 
 
251 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  40.72 
 
 
683 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  43.48 
 
 
661 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  42.77 
 
 
662 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  42.35 
 
 
667 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
640 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.43 
 
 
625 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.05 
 
 
640 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.44 
 
 
668 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 
643 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 
804 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3643  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.68 
 
 
241 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0834774  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  40.61 
 
 
681 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0934  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.45 
 
 
247 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1883  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.85 
 
 
228 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2669  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.29 
 
 
221 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  41.98 
 
 
704 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  39.68 
 
 
768 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  41.82 
 
 
807 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2935  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.57 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.137351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  35.75 
 
 
706 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  40.09 
 
 
669 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 
862 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  37.97 
 
 
718 aa  135  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1648  putative monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.85 
 
 
228 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.375739  hitchhiker  0.00248467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3058  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.4 
 
 
249 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  40.74 
 
 
744 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>