More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1294 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1294  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 472 aa  986    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2360  isopropylmalate isomerase large subunit  71.09 
 
 		 472 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0370  isopropylmalate isomerase large subunit  70.69 
 
 		 473 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0421  isopropylmalate isomerase large subunit  70.47 
 
 		 473 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09810  isopropylmalate isomerase large subunit  68.72 
 
 		 473 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0361  isopropylmalate isomerase large subunit  70.26 
 
 		 473 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.410569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3061  isopropylmalate isomerase large subunit  64.68 
 
 		 476 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3457  isopropylmalate isomerase large subunit  59.66 
 
 		 477 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.55 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  54.08 
 
 		 469 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0200  isopropylmalate isomerase large subunit  55.7 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.637292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  53.73 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  53.53 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  54.29 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  53.3 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  54 
 
 		 470 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6956  isopropylmalate isomerase large subunit  54.7 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43391  normal  0.604485 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  55.05 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  55.05 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  54.82 
 
 		 468 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  53.83 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  52.67 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  53.08 
 
 		 772 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  52.79 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1381  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.86 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.8068  normal  0.283608 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1445  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.86 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0303159  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  54.76 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  54.11 
 
 		 469 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1542  isopropylmalate isomerase large subunit  54.49 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.690084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  52.47 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.03 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.72 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  50.96 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  53.68 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  53.88 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.37 
 
 		 474 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  53.63 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  53.56 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  51.29 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.69 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  52.68 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  53.53 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  53.19 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  53.43 
 
 		 467 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  51.81 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1485  isopropylmalate isomerase large subunit  54.49 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  52.68 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  51.4 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  54.04 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  51.17 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  50.97 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  52.55 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  51.18 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  50.96 
 
 		 480 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  53.19 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.09 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.35 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.06 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.39 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  51.17 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.56 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  50.96 
 
 		 469 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  52.79 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2731  isopropylmalate isomerase large subunit  53.02 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  52.98 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  52.98 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  52.01 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  52.03 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  52.03 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4273  isopropylmalate isomerase large subunit  52.36 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  53.4 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  52.94 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  51.38 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  52.65 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  51.5 
 
 		 481 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  53.55 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  50.75 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>