More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3061 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2360  isopropylmalate isomerase large subunit  71.31 
 
 		 472 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09810  isopropylmalate isomerase large subunit  72.25 
 
 		 473 aa  688    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3061  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 476 aa  962    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1294  isopropylmalate isomerase large subunit  64.68 
 
 		 472 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3457  isopropylmalate isomerase large subunit  68.51 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0421  isopropylmalate isomerase large subunit  63.29 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0361  isopropylmalate isomerase large subunit  63.08 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.410569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0370  isopropylmalate isomerase large subunit  63.08 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0200  isopropylmalate isomerase large subunit  59.32 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.637292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  53.93 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.25 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  57.75 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  57.75 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  56.48 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  54.58 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  54.16 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  56.81 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  54.04 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2731  isopropylmalate isomerase large subunit  55.67 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  54.58 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  53.59 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  53.52 
 
 		 470 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  53.94 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  53.09 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  55.63 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  53.3 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 469 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  54.12 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  53.63 
 
 		 466 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4273  isopropylmalate isomerase large subunit  55.37 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  53.38 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  52.77 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  53.09 
 
 		 469 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  53.94 
 
 		 480 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  52.34 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  52.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  52.98 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  54.53 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  53.94 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  55.02 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.19 
 
 		 469 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  52.03 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.14 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  52.03 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  52.34 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1445  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.55 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0303159  normal  0.651921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  52.34 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  52.03 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  52.34 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1381  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.55 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.8068  normal  0.283608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  54.3 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  52.45 
 
 		 469 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  51.8 
 
 		 477 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  52.88 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  51.55 
 
 		 772 aa  495  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.37 
 
 		 470 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  51.91 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  54.76 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  52 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  54.47 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2732  isopropylmalate isomerase large subunit  53.6 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0458261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  51.7 
 
 		 466 aa  494  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  54.45 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  51.28 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  53.28 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  54.24 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  53.81 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  52.13 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  54.24 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  54.66 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  54.24 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  52.24 
 
 		 466 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  51.7 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>